整编军议的一开始，就宣布了汝宁军各支军团的组成和主官的任命。汝宁军的武装力量分为了战兵、民团和护庄、护路、护矿队。吴世恭将成为武装力量的最高指挥。
薛永利将为整支汝宁军战兵的正统领，周巡为副统领。但是他们在平时只能够指挥战兵军团，用现代的话来说，就是只能够指挥野战部队。只有在战时，在吴世恭的授权或者紧急状态下，他们才可以指挥就近的汝宁军其他武装力量。
而在这里，战兵将是全脱产、拿军饷的兵丁组成，武器装备也是最好，他们将是未来作战的主力。而这次汝宁军的战兵将增至一万五千人；
民团也升格为二线部队，也是全脱产，不过武器装备差一些，军饷也低一些。民团的主要任务就是防御要塞和维持地方的作用，还有在作战时起到运输和辅助的作用。形象地形容一下，就象是现代的武警部队一样。这次最终商议，民团建立了十二个，每个民团五百人，共六千人。
但其中有一个民团将比较特殊，就是余子琏为知县的那个民团。这个民团如何处置将由吴世恭和张学斌与姚员外这些归德当地士绅商议以后再做决定；
而护庄、护路和护矿队，就是半脱产的民兵组成了。他们将由退役的老兵率领，使用着汝宁军淘汰的武器和简陋的武器，为汝宁军控制地方起到作用。当然，在作战的时候，也能够辅助作战的。
由于吴世恭收容的难民增多，汝宁军将会让所有的适龄男丁共五万三千多人全部参加军训，并且规定每人在护庄、护路和护矿队每年服役一个月。因此在平时，这支民兵队伍将有四千五百人左右，但战时甚至可以总动员。
此外，还有薛强率领的一千五百人的内务司部队，他们平时将起到维持地方治安和剿匪的工作。当然，在剿匪的过程中，当获得授权以后，内务司可以让汝宁军的其他武装力量配合。
还有薛志农的山川司行动队和外围打行成员近五百人。这次吴世恭也将把这支武装力量正式归入汝宁军的管理。
至于归德卫赵铭指挥的那些军户，吴世恭准备让俞继这些原归德卫的军户通过关系渗透进去，争取尽可能多的归德卫军户支持。
还有就是盟军了，不过现在说得上归于汝宁军指挥的盟军，也只有南阳守备李禄率领的三百多名亲兵和南阳私铁矿矿主私募的一千一百多名家丁了。
但是这种同盟是相当松散的，只有在共同利益下，这些盟军才会归汝宁军指挥。而且除了李禄的亲兵以外，其他的那些盟友的战斗力，也就是比欺压百姓好上一些，根本就是靠不住。
汝宁军战兵的五大军团不变。吴世恭在军议上宣布了正副军团长和主要部队军官名单：
教导军团正军团长：李三河；副军团长：俞继；
南阳军团正军团长：赫飞；副军团长：楚格、吴书墨；
这两个是全编军团。
归德军团正军团长：薛强；副军团长：钱绮；
汝宁军团正军团长：杨如松；副军团长：梁辉；
这两个是半编军团。
骑兵军团正军团长：张彪；副军团长：薛存壮（原薛府护卫，提拔任命）；
直属炮队团长：熊正恩；副团长：巩本实；
熊正恩是原炮队副统领。而巩本实是原炮队技术最好的炮长，这次是破格提拔。
直属工兵团团长：薛存义（原薛府护卫，提拔任命，是薛存壮的堂弟）；副团长：郭明（原千户所堡垒军户，提拔任命）；
而陶辛被任命为亲兵大队大队长。
以下军官的任命也不细表了。不过这次整编，基本上所有的军官都升了一级。不过升迁最快的就是周巡、钱绮等四人，还有梁辉炮队的这些人。
这也可以看出，汝宁军中，多参加战斗的军官升迁就快，骑兵和炮兵的军官升迁也快。当然最高兴的就是这时候旁听的杨狗蛋，他是儿子、女婿双丰收。
南阳军团之所以设立俩位副军团长，主要是因为书墨还要主持龙眼寨和罗家镇大营的建造，还要为汝宁军组建起有效的前沿防线，所以暂时还是留任。
而冈萨雷斯这些葡萄牙的军官，除了几位造炮和造弹药的工匠调任到了工坊司以外，还留下了近二十名。他们暂时先作为顾问帮助此次整编，不授实职。
这次任命，还空余了副连长以上的军官五十几位左右，等此次整编结束以后，汝宁军中包括葡萄牙军官在内的优秀军官，才会提拔任命。
接下来就是安排整编军队的训练了。这些天，汝宁军的高层军官，结合迟明这些人记录整理的此次出征的所得，再加上葡萄牙军官的教授，初订成了汝宁军新操典和新战术手册。
在未来几个月的时间内，汝宁军将会按照这个新操典和新战术手册来训练兵丁。而这次将大量增加从十人队到整支军团联合作战的战术内容。当然，在训练中如果发现问题，也将修改增减新操典和新战术手册内容。
关于军队的内容基本上就是如此了。在吴世恭的安排下，除了直属部队副团长以上，驻外部队副军团长以上的高级军官留下接着进行军议以外，吴世恭让其他参加军议的军官尽快赶回自己的部队，开始招募新兵，加紧训练了。
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