不过，在东江军的武官心中，却对袁崇焕杀毛文龙的行为有了深深的恐惧和提防。功勋卓著的毛文龙都可以被袁崇焕轻易地杀死，那么他们这些小武官将来的日子也肯定会不好过的。
在将来的日子里，东江军中大批的武官和兵丁叛变，投奔到了皇太极的后金去。不过，虽然他们的行为也是有情可原的，但是只要是汉奸，那就是最最最让人给唾弃的。不管这些汉奸有多少了不起的理由。
毛文龙这个人，具有明朝当时武官的一切恶习，甚至还有些变本加厉。如果放在道德的法**，确实杀他十次头，也不算是冤枉他。
可是，毛文龙的东江军牵制了后金四分之一，也就是两旗的兵力。再加上东江镇的地理环境，正是辽东被后金俘获的汉民逃亡的要道。
我们已经知道，后金掌权的熟女真是以耕种粮食为主的。他们在以前基本上是把俘获的汉民当作奴隶，为他们耕种粮食用的，
而大批汉民逃亡以后，一些熟女真的壮劳力就不得不亲自耕种粮食，这也变相地消弱了后金军队的实力。因此，毛文龙的东江军在实际上牵制的后金兵力还要更多。光凭着这一点，毛文龙就可以一俊遮百丑啦。
再说，毛文龙的东江军，是由他带领着二百名兵丁发展到现在的几万军民的，毛文龙也确实是一个极有能力的将领。而他对明朝朝廷也是忠心耿耿的，也积极地和后金军队作战的。
这样的一个将领，袁崇焕说杀就杀，那不是完完全全地自毁长城吗？另外，袁崇焕诛杀毛文龙的行为，也是一个极其严重的违法行为。
袁崇焕手中有尚方宝剑，毛文龙手中也有天启皇帝赐予的尚方宝剑，所以，袁崇焕根本没有权力来杀毛文龙。之所以最后顺利地诛杀了，只是袁崇焕谎称这是崇祯皇帝的命令。这不就是扎扎实实的假传圣旨吗？
而当袁崇焕诛杀毛文龙的行为传到京城，崇祯皇帝是大惊失色。在崇祯皇帝的心中，是很清楚毛文龙在辽东的作用的。因此，崇祯皇帝也根本就没有想去清除毛文龙，甚至连毛文龙手中的尚方宝剑也没有收回。
但是崇祯皇帝想到了袁崇焕——五年平辽的誓言，又在身边那些东林党大臣的劝说之下，凭着疑人不用，用人不疑的原则，崇祯皇帝还是选择了支持袁崇焕。
崇祯皇帝在袁崇焕上呈的诛杀毛文龙原因的奏章的批复中，肯定了袁崇焕诛杀毛文龙的行为，先从法理上，堵住了袁崇焕假传圣旨的漏洞。并且下令有司抓捕毛文龙的余党。以此来维护袁崇焕的权威。
甚至当袁崇焕要求朝廷增发军饷，来安稳东江军军心的这个要求上，崇祯皇帝也捏着鼻子认了。同样满足了袁崇焕的要求。可是，袁崇焕的这个行为，已经在崇祯皇帝的心中深深地扎下了一根刺。
而当袁崇焕诛杀毛文龙，传到盛京的皇太极耳中时，皇太极是仰天长笑。皇太极根本就没有想到，扎在后金腰上的那两根刺，就这么轻易地给解决了。而其中毛文龙的这根刺竟然是给明朝官员自己给拔去的。
现在的后金军队，因为没有了东西两边的威胁，是完全放开了手脚。而在皇太极的心中，他终于可以开展和明朝作战的大战略了。
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